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12月9-15日生物統計和R語言應用培訓班

一、組織機構

主辦單位:中國科學院植物研究所

承辦單位:中國科學院植物研究所文獻與信息管理中心學術交流與培訓部

籌備組成員:組 長:崔金鐘

成 員:侯淑琴、傅燕鳳

二、培訓班目的和宗旨

生物學研究越來越離不開統計學。統計學不僅僅是一種工具,一種數據處理的方法。針對不同的研究對象應該采用怎樣的調查方法或者怎樣的實驗設計方法,應該用什么樣的統計學方法進行數據處理、分析和解釋,都將對研究的過程和結果產生重要的影響。從問題,實驗設計、到選擇合適的統計方法,再到數據分析結果的解釋,本身就是很重要的研究過程和研究結果。不僅要掌握數據處理的方法,更需要理解每種方法所蘊涵的統計學的思想,而后者常常容易被忽視,甚至導致統計方法的濫用。本班擬從問題出發,進行實驗設計、選擇合適的統計方法,再到數據分析結果的解釋的過程中,講授常用的生物學實驗設計和統計方法。

R語言是一個用于統計計算和統計制圖的優秀軟件。盡管R語言的歷史不長,但以其開源、自由、免費等特點已經風靡全球,逐漸成為科學家的第二語言。目前R的使用者呈幾何級數增加。R語言也逐步受到國內科研工作者,特別是青年學者和研究生的青睞。近年來隨著數據分析方法和數學模型在生態學和生物多樣性研究中的迅速發展,傳統的統計軟件已經很難滿足迅速發展的數據分析要求。R軟件以其靈活、開放、易于掌握、免費等諸多優點,在生態學和生物多樣性研究領域迅速贏得研究者的青睞。然而,與國外相比,R軟件在國內生態學和生物多樣性研究中的應用還相對較少。目前,國內生態學界使用R的學者越也來越多,特別是青年學者和研究生。近年來,沿著緯度梯度在我國東部森林區的建立數十個森林大樣地構成中國森林生物多樣性監測網絡(Chinese Forest Biodivsity Monitoring Network, CForBio)。為了分析大樣地龐大數據的需要,R已經成CForBio研究人員為最主要的分析的工具。目前CForBio所發表50多篇SCI文章基本上都是引用R作為數據分析工具,這些成果的發表也促進R在國內生態學界的推廣和應用。

為了讓從事生物學科研工作者了解和使用R,中國科學院植物研究所在2012年12月9日到15日再次舉辦“生物統計和R語言應用培訓班”。此次培訓班目的在于讓R的初學者盡快掌握R的用法并熟練應用到自己研究當中。

三、參加人員要求

參加人員需具備一些基本的統計學基礎知識

四、適合的參加者 

從事生態學研究的老師及研究生和生物多樣性相關研究的生態學者。包括研究者、碩士、博士研究生、博士后等。

五、授課內容

主講人

授課內容

時間

王世暢博士、助理研究員

(中科院植物所)

1. 生物統計學基礎知識

2. 常用統計方法簡介

3. 實驗設計、數據處理及結果推斷

一天

劉國方博士

(中科院植物所)

1. R語言簡介,R語言數據類型、結構、流程控制、循環、自定義函數;

2. R語言基礎函數講解,批量數據的統計計算;

3. R語言繪圖(低階作圖和高階作圖);

4. R語言文本數據操作(正則表達式、文本操作有關的函數)及實例講解。

兩天

毛嶺峰博士

(中科院植物所)

1、R語言編程基礎與基礎統計實現

編程技巧、案例、程序包應用、主要基礎統計實現和統計函數應用。

2、R語言在進化和生態學分析中的應用

相關應用案例分析

一天

金冬梅博士

(北京大學城環學院)

譜系分析在生態學中的應用、實例及R實現

半天

 

參觀植物所標本館及植物園

半天

六、培訓班時間

 2012年12月9日 14:00 報到:10日-14日上課;15日培訓班結束

七、培訓班語言及條件

中文講課、參加者需自備計算機或移動硬盤

八、培訓班地點

北京市海淀區香山南辛村20號,中國科學院植物研究所內(會議室待定)

九、注冊費、住宿費

1.注冊費:1200元,學生1000元(包括教師講課費、資料費、會議室租用費、茶水費、中晚餐費等)。我們在收到注冊費15天內給您用E-mail發第二輪通知。

2.住宿自理。會務組推薦以下住宿并幫助預定,請在上網注冊時在擬訂賓館處打“√”

請訂住宿:

( )香山飯店   標間 480/天(屬政府采購定點飯店);

( )香山世紀金源 標間 350/天(屬政府采購定點飯店,訂五間以上350/天);

( )香山寶怡山莊 標間 240/天(非政府采購定點飯店);

( )北京香泉賓館 標間 180/天(非政府采購定點飯店);

十、培訓班注冊               

1. 通過培訓班網站(http://peixun.ibcas.ac.cn/swtjx )在線注冊,并盡快繳納注冊費(要求網上注冊,不接受當天現場注冊)。如注冊后有特殊情況不能出席,請盡快告訴我們。如于開班前5天告訴我們,退回50%注冊費,在培訓班開始后告知,不退注冊費。
2. 注冊費請匯到
單  位:中國科學院植物研究所
開戶銀行:工行北京分行海淀西區支行
賬  號:0200004509088100989

3.匯注冊費時請寫明您的姓名和生物統計學培訓班


   十一、培訓班聯系方式

網   址: http://peixun.ibcas.ac.cn/swtjx       

參加者請于11月30日前上網注冊,并繳納注冊費。

聯系地址:中國科學院植物研究所文獻中心學術交流與培訓部

北京市海淀區香山南辛村20號 北京100093

電   話:010-62836216

E-mail:fyf@ibcas.ac.cn hsq50@ibcas.ac.cn

 二O一二年十月十六日

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